聚合酶链式反应实验类似于DNA的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
PCR由变性--退火(复性)--延伸三个基本反应步骤构成：
①模板DNA的变性：模板DNA经加热至90~95℃一定时聚合酶链式反应间后，使模板DNA双链或经pcr扩增形成的
双链DNA解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准备;
②模板DNA与引物的退火(复性)：模板DNA经加热变性成单链后，温度降至55~60℃，引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;
③引物的延伸：DNA模板--引物结合物在DNA聚合酶的作用下，于70~75℃，以dNTP为反应原料，靶序列为模板，
按碱基配对与半保留复制原理，合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链重复循环变性--退火--延伸三过程，
就可获得更多的“半保留复制链”，而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2～4分钟，
2～3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。
聚合酶链式反应实验中退火温度是最重要的参数之一。在退火温度不太明确时，为了找到最优退火温度，可以使用梯度PCR。
温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时，为了找到最优退火温度，在一台PCR仪上同时做多管PCR，每一管放在仪器内不同列
(有的是不同行)上，分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管，分别为50，52，54，56，58，60度)，最后看看哪个温度的效果最好。